| ACME | Bio::EnsEMBL::Analysis::RunnableDB::Funcgen::ACME |
| Chipotle | Bio::EnsEMBL::Analysis::RunnableDB::Funcgen::Chipotle |
| MAT | Bio::EnsEMBL::Analysis::RunnableDB::Funcgen::MAT |
| Nessie | Bio::EnsEMBL::Analysis::RunnableDB::Funcgen::Nessie |
| SWEmbl | Bio::EnsEMBL::Analysis::RunnableDB::Funcgen::SWEmbl |
| Splitter | Bio::EnsEMBL::Analysis::RunnableDB::Funcgen::Splitter |
| TileMap | Bio::EnsEMBL::Analysis::RunnableDB::Funcgen::TileMap |